小黃魚全基因組精細圖譜首次繪制
科技日報訊 (洪恒飛 王夏君 記者江耘)近日,科技日報記者從浙江省農(nóng)業(yè)科學院(以下簡稱浙江省農(nóng)科院)獲悉,該院水生生物研究所小黃魚科研團隊與廈門大學、美國奧本大學合作,首次完成了小黃魚全基因組組裝注釋與精細圖譜繪制,為建立小黃魚基因組選擇育種、培育高產(chǎn)抗病優(yōu)質(zhì)良種提供了基因資源和技術(shù)手段。相關(guān)研究論文近日在線發(fā)表于學術(shù)期刊《分子生態(tài)學資源》。
小黃魚是中國重要的海產(chǎn)經(jīng)濟魚,味道鮮美,廣受青睞。隨著小黃魚全養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的擴大和科研的深入,破譯小黃魚基因組,發(fā)掘其生長、性別決定等相關(guān)重要功能基因成為擺在科研工作者面前的重要課題。
“黃魚屬包含東海四大海產(chǎn)中的小黃魚與大黃魚兩個重要經(jīng)濟魚類,雖然它們形態(tài)和染色體核型相似,但是黃魚屬物種之間的遺傳關(guān)系尚未明確。”論文第一作者、浙江省農(nóng)科院水生生物研究所(以下簡稱水生所)助理研究員謝慶平博士介紹,本研究結(jié)合4類基因組測序技術(shù),構(gòu)建了小黃魚染色體水平的基因組精細圖譜;揭示小黃魚基因組大小為706兆,注釋基因為25233個;進化分析表明小黃魚與大黃魚親緣關(guān)系最近,大概在2540萬年前開始分化。
謝慶平介紹,魚類雌雄同體和雌雄異體的演化方向,在學術(shù)界仍然是一個有待解決的有趣謎團。此次研究通過轉(zhuǎn)錄組學、比較基因組學以及分子生物學的技術(shù)方法,鑒定出dmrt1基因為小黃魚的雄性特異性基因,且dmrt1基因序列的演化可以作為魚類中雌雄同體現(xiàn)象產(chǎn)生的生物標記。
論文通訊作者、浙江省農(nóng)科院水生所所長樓寶研究員表示,小黃魚全基因組的解譯和基因組精細圖譜的繪制,對于海洋漁業(yè)資源保護、小黃魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)化以及分子遺傳育種技術(shù)的研究意義重大。
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